ImageJ, es multiplataforma ya que está escrito en Java, pero propone dos modalidades de acceso, sea como applet introducida en un navegador web sea como aplicación de escritorio mediante la maquina virtual Java.

Inútil de buscar las brochas, pinceles y demás paletas de herramientas propias de los editores como PhotoShop, aquí lo que importa es el análisis y el procesamiento de la imagen. Es compatible con imágenes de 8, 16 o 32-bits y puede con los formatos TIFF, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS y RAW. Además es multitarea, por lo que actúa con suma rapidez.